Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms