Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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FOXC1Q12948 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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