Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STX4Q12846 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STX4Q12846 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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