Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms