Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4DQ08499 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms