Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms