Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms