Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG2P63267 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms