Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms