Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRPF1P55201 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms