Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIRAP54198 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms