Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HK3P52790 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HK3P52790 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HK3P52790 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HK3P52790 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HK3P52790 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms