Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DAP3P51398 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms