Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms