Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms