Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms