Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGCXP38435 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGCXP38435 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGCXP38435 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGCXP38435 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms