Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFNP31947 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFNP31947 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFNP31947 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFNP31947 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms