Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms