Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms