Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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