Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUSP1P28562 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms