Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT1P26358 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms