Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF1P21675 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1P21675 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1P21675 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1P21675 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1P21675 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1P21675 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1P21675 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1P21675 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms