Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms