Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRHP20396 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRHP20396 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRHP20396 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRHP20396 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRHP20396 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms