Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms