Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms