Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms