Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAV1P15498 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAV1P15498 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAV1P15498 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAV1P15498 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAV1P15498 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAV1P15498 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAV1P15498 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAV1P15498 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAV1P15498 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAV1P15498 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms