Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms