Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms