Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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