Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX7O95931 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX7O95931 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms