Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms