Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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