Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRGAP3O43295 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRGAP3O43295 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms