Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP290O15078 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP290O15078 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP290O15078 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP290O15078 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP290O15078 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP290O15078 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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