Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD1AO15047 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1AO15047 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms