Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NFKBIEO00221 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIEO00221 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms