Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E9PBE3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E9PBE3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
E9PBE3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E9PBE3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E9PBE3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
E9PBE3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E9PBE3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E9PBE3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
E9PBE3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E9PBE3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms