Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms