Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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