Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4E171 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4E171 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4E171 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4E171 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4E171 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4E171 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4E171 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4E171 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4E171 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms