Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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C4orf47A7E2U8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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C4orf47A7E2U8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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C4orf47A7E2U8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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C4orf47A7E2U8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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C4orf47A7E2U8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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