Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6BA6NDN3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6BA6NDN3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms