Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SSPOA2VEC9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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