Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms