Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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