Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRPF3Q9ULD4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms